Details for gene set KEGG_ALZHEIMERS

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_PVAL
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	KEGG_ALZHEIMERS_DISEASE
Enrichment Score (ES)	0.14004634
Normalized Enrichment Score (NES)	1.9952605
Nominal p-value	0.01
FDR q-value	0.08463141
FWER p-Value	0.401

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	NDUFB5	92	0.997	0.0015	Yes
2	COX7A2L	257	0.988	-0.0009	Yes
3	SDHA	475	0.973	-0.0061	Yes
4	COX6B1	537	0.970	-0.0029	Yes
5	CYCS	661	0.963	-0.0031	Yes
6	ATP5F1	755	0.959	-0.0016	Yes
7	COX4I2	774	0.958	0.0039	Yes
8	NDUFS1	794	0.957	0.0094	Yes
9	NDUFV1	919	0.952	0.0091	Yes
10	NDUFA4L2	973	0.949	0.0128	Yes
11	UQCR10	996	0.948	0.0181	Yes
12	UQCRB	1057	0.944	0.0213	Yes
13	CACNA1F	1219	0.934	0.0191	Yes
14	COX7A2	1253	0.932	0.0238	Yes
15	IDE	1259	0.932	0.0300	Yes
16	CALM1	1285	0.930	0.0352	Yes
17	CALML6	1353	0.927	0.0380	Yes
18	CASP8	1403	0.925	0.0419	Yes
19	NDUFB4	1463	0.922	0.0452	Yes
20	NDUFV2	1538	0.918	0.0477	Yes
21	NDUFA9	1641	0.912	0.0486	Yes
22	NDUFB7	1815	0.903	0.0458	Yes
23	COX4I1	1842	0.901	0.0508	Yes
24	NDUFA10	1874	0.899	0.0557	Yes
25	NDUFB1	2304	0.878	0.0389	Yes
26	NDUFA8	2307	0.877	0.0453	Yes
27	NDUFC2	2311	0.877	0.0517	Yes
28	CACNA1S	2313	0.877	0.0581	Yes
29	FAS	2466	0.868	0.0564	Yes
30	NDUFA2	2469	0.868	0.0627	Yes
31	PSENEN	2975	0.840	0.0419	Yes
32	NDUFS4	3028	0.837	0.0456	Yes
33	NDUFA6	3047	0.836	0.0511	Yes
34	ATP5J	3155	0.830	0.0518	Yes
35	ATP5A1	3220	0.825	0.0548	Yes
36	GNAQ	3312	0.821	0.0564	Yes
37	NDUFS7	3444	0.815	0.0558	Yes
38	NDUFC1	3709	0.800	0.0480	Yes
39	NDUFS2	3811	0.795	0.0490	Yes
40	SDHB	3846	0.793	0.0537	Yes
41	COX5B	3873	0.791	0.0588	Yes
42	ATP5G3	3935	0.788	0.0620	Yes
43	NDUFS8	4028	0.783	0.0635	Yes
44	NDUFA5	4170	0.775	0.0624	Yes
45	ATP5B	4205	0.773	0.0670	Yes
46	ATP5E	4274	0.769	0.0698	Yes
47	COX7B	4491	0.759	0.0646	Yes
48	UQCRFS1	4492	0.758	0.0711	Yes
49	MAPK3	4534	0.756	0.0754	Yes
50	NDUFA1	4553	0.755	0.0809	Yes
51	COX6B2	4573	0.753	0.0864	Yes
52	NDUFB8	4626	0.751	0.0901	Yes
53	CASP9	4714	0.746	0.0918	Yes
54	NDUFA3	4751	0.744	0.0964	Yes
55	UQCRC1	4947	0.732	0.0923	Yes
56	HSD17B10	5030	0.727	0.0944	Yes
57	UQCRH	5141	0.720	0.0949	Yes
58	NDUFB3	5201	0.717	0.0982	Yes
59	NDUFB2	5218	0.716	0.1039	Yes
60	MAPT	5281	0.711	0.1070	Yes
61	NDUFB9	5359	0.708	0.1093	Yes
62	NDUFS6	5443	0.704	0.1113	Yes
63	CALM3	5496	0.701	0.1150	Yes
64	UQCRQ	5527	0.699	0.1199	Yes
65	NDUFV3	5633	0.694	0.1207	Yes
66	CALM2	5650	0.693	0.1263	Yes
67	BACE1	5651	0.693	0.1328	Yes
68	COX6C	5738	0.689	0.1346	Yes
69	ATP5O	5870	0.682	0.1340	Yes
70	ATF6	5880	0.682	0.1400	Yes
71	NDUFA4	6113	0.669	0.1340	No
72	CASP3	6300	0.659	0.1304	No
73	SDHC	6516	0.648	0.1253	No
74	PPP3CC	6672	0.639	0.1234	No
75	PLCB3	6674	0.639	0.1298	No
76	CYC1	6921	0.625	0.1230	No
77	ATP5D	7271	0.606	0.1106	No
78	NDUFB6	7348	0.602	0.1130	No
79	COX7C	7475	0.596	0.1127	No
80	UQCRC2	7478	0.595	0.1190	No
81	ATP5C1	7522	0.593	0.1232	No
82	NDUFS3	7581	0.591	0.1266	No
83	APH1A	7648	0.587	0.1295	No
84	NDUFS5	7887	0.574	0.1231	No
85	GRIN2D	7888	0.574	0.1296	No
86	COX8C	7956	0.570	0.1325	No
87	ATP5G2	8170	0.559	0.1274	No
88	CACNA1D	8390	0.546	0.1221	No
89	GRIN1	8551	0.537	0.1199	No
90	ATP5G1	8567	0.536	0.1256	No
91	COX8A	8626	0.533	0.1289	No
92	PPP3CB	8704	0.528	0.1313	No
93	CALML3	8876	0.518	0.1285	No
94	PSEN1	9114	0.504	0.1222	No
95	PLCB1	9123	0.504	0.1282	No
96	APAF1	9175	0.501	0.1320	No
97	ATP5H	9439	0.488	0.1242	No
98	ADAM17	9537	0.483	0.1255	No
99	BACE2	9632	0.478	0.1269	No
100	UQCR11	9640	0.478	0.1330	No
101	GAPDH	9709	0.474	0.1358	No
102	COX6A1	9770	0.470	0.1390	No
103	COX5A	10349	0.437	0.1142	No
104	TNF	10436	0.432	0.1161	No
105	GRIN2A	10465	0.430	0.1211	No
106	NDUFB10	10987	0.403	0.0994	No
107	COX7B2	11109	0.396	0.0993	No
108	NDUFA7	11254	0.388	0.0980	No
109	COX7A1	11302	0.385	0.1020	No
110	RYR3	11597	0.369	0.0925	No
111	ATP2A3	11841	0.354	0.0859	No
112	CASP7	11852	0.353	0.0918	No
113	COX6A2	11876	0.351	0.0971	No
114	NDUFAB1	12255	0.329	0.0831	No
115	PLCB4	12389	0.322	0.0824	No
116	NCSTN	12397	0.321	0.0885	No
117	LRP1	12432	0.319	0.0932	No
118	PPP3R2	12623	0.308	0.0894	No
119	SDHD	12795	0.298	0.0866	No
120	ATP2A1	12895	0.293	0.0878	No
121	ATP2A2	13226	0.274	0.0764	No
122	PLCB2	13599	0.254	0.0628	No
123	APOE	14138	0.224	0.0401	No
124	MAPK1	14214	0.220	0.0426	No
125	CAPN1	14230	0.219	0.0483	No
126	CHP2	14267	0.217	0.0528	No
127	CACNA1C	14570	0.200	0.0429	No
128	ERN1	14622	0.198	0.0467	No
129	ITPR3	14856	0.186	0.0406	No
130	BID	15247	0.164	0.0259	No
131	CAPN2	15542	0.149	0.0165	No
132	APBB1	15619	0.146	0.0189	No
133	TNFRSF1A	15678	0.143	0.0223	No
134	PPP3CA	15731	0.140	0.0259	No
135	BAD	15775	0.137	0.0301	No
136	NAE1	15875	0.132	0.0312	No
137	PPP3R1	15909	0.130	0.0360	No
138	MME	16033	0.122	0.0358	No
139	GSK3B	16137	0.117	0.0367	No
140	IL1B	16195	0.114	0.0401	No
141	FADD	16283	0.109	0.0419	No
142	NOS1	16304	0.108	0.0473	No
143	ITPR1	16700	0.087	0.0324	No
144	GRIN2C	16867	0.079	0.0299	No
145	ADAM10	16873	0.078	0.0362	No
146	ITPR2	16933	0.075	0.0395	No
147	CDK5R1	17185	0.063	0.0324	No
148	EIF2AK3	17373	0.053	0.0287	No
149	APP	17769	0.034	0.0139	No
150	CDK5	17915	0.028	0.0125	No
151	SNCA	18004	0.024	0.0142	No
152	PSEN2	18021	0.022	0.0199	No
153	GRIN2B	18516	0.002	-0.0004	No
154	LPL	18606	0.000	0.0013	No